Peer Review for authors before submittion

 

Verbascoside inhibits cell proliferation, migration, and invasion of oral squamous cell carcinoma by the METTL3-mediated miR-31-5p/HIPK2 axis

 

 

根据<<手稿审查批注/修改意见工作指南>>里的7 点，都基本上OK， 文章没有逻辑上，数据上显而易见的缺陷和不足， 但文章没有亮点，没有创新, 作者缺乏药物筛选方面的专业考虑（当然不是药物筛选文章）。

 

研究的方法/实验设计基本合理，方法和实验过程基本恰当，虽然 整个思路在METTL3/ miR-31-5p/HIPK2信号上分析的差异没有冲突，也观察到合理的变化。 但已经有相似报道。

 

结果及结论基本OK:

Fig. 2, 4, 7 图解需要更清晰：Fluorescence images of anti-BrdU assay of cell division and proliferation after compound treatment.

 

transwell 的图片质量都不好， 主要是显微镜没有聚焦好， 计数可能会带来偏差

 

EDU assay中 可能20M浓度太高， 导致520 nm 反射光（红）太强， 以致完全覆盖DAPI （green）染色， 这可能导致计数误差。

 

标题与摘要基本OK(但需要修改)，毛蕊花苷购买于成都，但必须有公司名，甚至批次。 作为严格的剂量测试， 应该还缺一个(更高的)剂量， 现在看不到这个分子是否是剂量依赖性? 还是非剂量依赖型。

 

 

当然需要 伦理批文号，  讨论部分需要补充。经过专业修改后，可以突出主要发现，提高文章分量及阅读兴趣」当然还有很多细节需要通过peer review改进。

 

参考文献引用基本合理；文章整体结构、语言语法等基本Ok, 图表漂亮、

 

很多缩写没有全称如 RIP (RNA immunoprecipitation), MeRIP (methylated RIP)

 

整个工作背景不够详细，比如M6A binding protein 在转录后甲基修饰等， 包括材料与方法不够详细， 这样容易感觉刚性数据不多， 高分杂志可能拒稿。还有可能需要看作者的前期工作 （以前发表的文章）是否以前有Mettl3, 以及miR-31-5p/HIPK2方面的工作。

 

 

 

 

提高手稿分量的途径

 

就目前这个毛蕊花苷(Verbascoside)文章看上去还可以，但这个文章方法，思路没有什么新意, 与

Zhang Y, Yuan Y, Wu H, Xie Z, Wu Y, Song X, Wang J, Shu W, Xu J, Liu B, Wan L, Yan Y, Ding X, Shi X, Pan Y, Li X, Yang J, Zhao X, Wang L. Effect of verbascoside on apoptosis and metastasis in human oral squamous cell carcinoma. Int J Cancer. 2018 Aug 15;143(4):980-991. doi: 10.1002/ijc.31378. Epub 2018 Apr 16. PMID: 29536537.  这个文章非常相似(不雷同，只是相似)， 还有其它几个也都非常相似。所以要按目前的文章投只能是1－2分的杂志才有可能。

 

作者如果想提高文章的重量，可能需要分析Verbascoside的具体的分子靶点。然后提出分子修饰方法(就是在Verbascoside分子上加什么甲基，羟基， 或者去掉什么基团). 因为

Verbascoside这个分子最早是从花叶假杜鹃， 或者野迎春植物分离出来的， 在长期自然选择的过程中，这些自然分子用于药物一般需要剂量比较高(从图1， 就已经看到这个200uM仍然没有到达IC50的值, 估计作者也没有IC50的考虑)， 从METTL3(甲基转移酶样蛋白3)分析来看，作者只是做了定性分析，而没有IC50分析. 目前文献来看Verbascoside的主要靶点可能是几个激酶，当然也不排除METTL3, 这个蛋白不知道其结构是否已经有(作者可以在www.pdb.org).

比如这个工作STM2457结合METTL3 （Yankova, Eliza et al. “Small-molecule inhibition of METTL3 as a strategy against myeloid leukaemia.” Nature vol. 593,7860 (2021): 597-601. doi:10.1038/s41586-021-03536-w）STM2457 (粗， 显示整个分子) ， METTL3 (细， 只显示部分蛋白)

 

现在Verbascoside的靶点，已经有人报道一些激酶，  比如Tyrosine kinase. 而作者没有考虑做磷酸化，及去磷酸化(激酶)这两类抗体的免疫分析，当然这个通路也是很通常的 就是已经研究很多了的MAP kinase 通路，与 细胞生长，细胞凋亡等相关。而这些都不是成为处方药物的基础， 处方药物需要一个特异性的靶点， 而且成剂量依赖，就是只在一定的剂量作用有效。因为生物衍生的小分子在人体内，甚至细胞内一般都会被代谢成更小的分子(药物代谢， 药代))。很多抑制，或者激活，或者其它功能实际上是代谢后的小分子，而不是原来最初使用的分子。人工合成的分子体内没有任何酶可以降解， 所以一般不存在体内药代的问题。当然这些一般是制药公司的事，他们也是需要层层专利保护的。而且现在也是人工智能机器人来完成这些大量筛选工作。

 

 

如果是考虑非药物筛选为重点， 哪需要一些相互作用方面的工作， 比如双抗体，或者多抗体下的共聚焦分析等等。